入力済の各案件にかけた工数の情報をCVSで取り出すことができますか？

はい、可能です。
工数メニュー→月別工数入力一覧→グラフの上部にある工数一覧をクリックすると工数一覧画面が閲覧できます。
そちらにて確認したい案件を表示させた後、一覧の下部にございます「検索した内容を案件別工数CSVダウンロード」を実行していただくと案件ごとに誰が何時間かけたかをCSVにてダウンロードすることができます。